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TUhjnbcbe - 2021/1/20 9:09:00
“医学方”由一批临床医师和科研人创立,始终致力于服务“医学人”,将最前沿、最有价值的临床、科研原创文章推送给各位临床医师、科研人员大家好,我是重画世界,上一期我们理清了计算生存率各个参数的意义以及他们之间的联系。这节课,我们将实际操作讲解各个生存率的计算。

首先,我们先来看下实际生存率(ObservedSurvivalOnly)

假设我们计算-年期间大肠癌的5年生存率情况,为简便运算和便于讲解,我们以软件默认的参数运行计算

由于选择了年龄校正后的生存率,进行结果后总共有三页结果展示

具体点击切换窗口如下

一个是cumulativesummary,结果里包括实际生存率和经年龄校正后的生存率以及可信区间上下限

另外一个是年龄校正后的生存表,以一个月为单位,各个时间内的起始生存人数、死亡数和失访数。Observed下Interval表示每一个间隔内的生存概率以及随后经年龄校正后的累积生存概率就是我们通常所说的生存率,从结果这一栏我们可以知道-年期间诊断的大肠癌患者3年和5年生存率分别为65.4%,56.1%。

由于年龄校正的生存表是只到99岁,所以这个Age-Standardizedlife是排除了岁以上的人群,在第三个结果表格中纳入了所有年龄段的人群,未经年龄校正,由表中结果可知3年和5年生存分别为65.0%与55.5%。

下面来熟悉下第二个指标——相对生存率,还是一样的限定标准,根据上节课的内容,此时相对生存率代表-年期间大肠癌患者因大肠癌而死亡的生存率的计算

同样为了简便运行,我们就将statistic设置如下即可

同样结果窗口还是有3页,由于内容大部分和observedsurvival相似,我们选择不同的变量进行讲解,

Observed和之前展示的结果一样的,是包括所有死因的生存率,expected和expectedagestd是指所有年龄段人群的期望生存率(包括正常人群和所有患病人群的总人群)以及经年龄校正后的所有年龄段人群的期望生存率,Relativeagestd和relative就是我们所求的相对生存率,平常我们阅读文献所看到的生存率就是指这个,这里可以看到大肠癌的3年和5年生存率有71.3%和65.1%。

另外看到第二页和第三页的结果也多了些内容,多了expected和relative各个间隔生存概率和累积生存概率

需要注意的是这里的生存率是包括了前面3个月随访时间内的生存率,而前3个月内手术并发症的存在相对死亡率会偏高,所以往往需要排除前面3个月内死亡的人群,这个时候需要用到什么参数呢?大家结合上节课的内容努力想想

再想想

对啦,就是Conditionalsurvival,我们需要用这个计算从第4个interval到63个interval的累积生存率,从诊断后3个月开始计算到生存5年的生存率,在parameters里选择限定条件,

出来的结果可以知道排除因前面3个月内手术切除大肠癌死亡的因素,5年相对生存率为69.2%。

接下来,我们先来看下CauseSpecificsurvival。这个指标上面介绍过可以计算特定死因的生存率,我们用SEER自带的一个特定死因的生存率,前面介绍的Relativesurvival把所以只要患有大肠癌的肿瘤全部纳入计算生存率,而CauseSpecificsurvival排除了那些第一个肿瘤不是大肠癌的患者,所以计算得到的生存率会比Relativesurvival相对准确些,也比Relativesurvival相对高些,下面我们来演示CauseSpecificsurvival的计算。

需要注意的是CauseSpecificsurvival的计算需要在selection窗口选择multipleprimaryselection里选择firstprimaryonly才是准确的,因为SEER设计CauseSpecificsurvival是根据firstprimaryonly设定的。

运行之后得到的结果如下,可以看到我们获得的起始纳入人群中,人比之前两个指标计算的人群数要少,这是因为排除了notfirsttumors的病人,这个是CauseSpecificsurvival所特有的,另外排除了这些病人之后,5年生存率也会相对提高,65.4%比Relativesurvival相对高了0.4%。

那么今天先讲到这里,希望大家将练习进行到底!!!我们下期再见。

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